AREA I

Se conoce como Casa del Virrey. En ella se reviven las etapas fundamentales de nuestra historia. Los bellos patios del Cabildo son testigos de prisioneros célebres, como el Gral. Carr Beresford y el Cnel Pack, trasladados allí luego de las frustradas invasiones inglesas. También recorrieron esos rinconces los generales argentinos Manuel Belgrano, Cornelio Saavedra, José María Paz y Bartolomé Mitre. En sus calabozos estuvieron apresados los hermanos Reinafé y el capitán Santos Pérez por el asesinato de Facundo Quiroga. Hay salas denominadas Villa de Luján e Historia de Luján, donde pueden verse testimonios históricos de las invasiones inglesas, armas, cabildantes, Independencia, Gral. Paz, Rosas, Lavalle, Guerra del Paraguay y Presidencias Argentinas. También objetos que pertenecieron al fundador del Museo, Don Enrique Udaondo.

AREA II

Ubicada en la manzana rodeada por las calles Lavalle, 25 de Mayo, Lezica y Torrezuri y la avenida Ntra. Sra. de Luján. Pueden verse la carreta de San Martín, la sopanda de Belgrano, la berlina punzó de Rosas, la locomotora La Porteña, la carroza de Sarmiento, la carroza de los gobernadores, la victoria de Roca, el yate de Vito Dumas, los caballos Gato y mancha, el hidroavión Plus Ultra, el Papamovil, entre carretas, berlinas, tranvías y sillas de mano, velocípedos, piraguas, automóviles históricos, y elementos vinculados a los transportes en general.
En el Area se encuentra el Archivo Estanislao Ceballos, con un fundamental repositorio documental, actas del Cabildo de Luján, documentos del Juzgado de Paz y el Municipio, cartas manuscritas originales del archivo Mitre y otros personajes de nuestra Historia. También existe una valiosa hemeroteca histórica y un archivo fotográfico.
En el lugar se encuentra la Biblioteca Peña inaugurada en 1979 con una enorme variedad de textos, entre ellos el incunable De la diferencia entre lo temporal y lo eterno, impreso en las misiones jesuíticas.

AREA III

En el pabellón Manuel Belgrano, puede verse el primer monumento erigido al procer en nuestro país. se exhiben cuadros y objetos que homenajean al ilustre creador de la bandera nacional. En este pabellón se encuentra un lugar reservado para una sala de armas y parte del museo del automóvil.

AREA IV

Allí se encuentran laboratorios y talleres de mantenimiento. También puede verse la Casa Colonial de Josefa galarza, ubicada en Lezica y Torrezuri 881, construida en el S XIX. Allí pisos de ladrillos, techos sostenidos por cañas y troncos de palmera y unidos con tientos de cuero. Las inundaciones han dañado duramente este sector y se realizan permanentes esfuerzos para mantener su patrimonio.

SALAS HABILITADAS

Casa Cabildo
Construcción colonial del siglo XVIII que fuera sede del Cabildo de la Villa de Luján. Creado por orden de Fernando VI, Rey de España.
Testigo del pasado de la villa. Sus salas albergaron a los prisioneros de las Invasiones Inglesas de 1806, al General José María Paz en 1835, al General Machado, al General Bmé. Mitre, entre otros personajes de nuestra historia.
Sus calabozos mantienen el estilo de la época con sus postes de ñandubay empotrados en los muros, grillo y cepos.

Sala del Gaucho
Costumbres y tradiciones van de la mano en este recorrido a través del tiempo.
El personaje central: el gaucho. ¿Qué era la pulpería? Vestimentas originales, platería criolla, historia del mate, los payadores.
Martín Fierro y Don Segundo Sombra, obras cumbres de la literatura gauchesca.

Sala Federal
La historia del restaurador de las leyes, su familia, lo hechos más importantes de gobierno.
Muebles, pinturas y obetos personales de Juan Manuel de Rosas.
Los personajes más importantes de su época.

Sala Arte Hispanoamericano
Platería, orfebrería civil y religiosa. Técnicas de trabajo. Pintura cuzqueña y quiteña, imaginería de culto y de vestir. La fusión entre lo español y lo aborígen a través del arte.

Guerra del Paraguay
La Guerra de la Triple Alianza vista a través de elementos de la época.
Uniformes, trofeos militares, Cándido López "el pintor de la guerra", las batallas más importantes. Causas y consecuencias del conflicto.

Modas
La moda de 1860, accesorios femeninos y masculinos, el mobiliario de la época, trajes, un vestido de novia, el dormitorio de Nicolás Avellaneda, entre otros objetos.

Presidencias
Importancia de la Constitución de 1853 para la formación del Estado Nacional.
La secesión nacional, presidencias liberales, la generación del '80, la revolución del '90 y el surgimiento de la UCR.
Argentina "granero del mundo", la Ley Saenz Peña y la etapa radical.
Revolución de 1930 y la etapa conservadora. La era justicialista, Eva Perón.
Economía y política interna y externa del período 1860-1955.

Capilla
Arte religioso, los jesuitas y su labor en las reducciones, tallas, relicarios y retablos.

MUSEO DE TRANSPORTE
Principales transportes exhibidos
· Carreta quinchada del campamento de Plumerillo, perteneciente al Gral. Don José de San Martín.
· Berlina de la familia de Juan Manuel de Rosas.
· Break de caza del Gral. Julio A. Roca
· Tranvía de la empresa Anglo Argentina
· "La Porteña" primera locomotora a vapor de orígen inglés de la Argentina
· Sopanda de la época de la Revolución de Mayo perteneciente a la familia Castaño
· Gato y Mancha, ejemplares de caballos criollos que unieron Buenos Aires con Nueva York
· LEG, bote que perteneció a Vito Dumas, el navegante solitario.
· PLUS ULTRA, hidroavión de origen español que unió España con Buenos Aires tripulado por Ramón Franco
· Carretas utilizadas en la campaña bonaerense para el transporte de frutas y verduras hasta Buenos Aires
· Transportes pertenecientes a Bmé. Mitre, Julio A. Roca y otros personajes ilustres del país.